哥斯拉VS碧奥兰蒂

哥斯拉掉入三原山五年后，日本迎来了短暂的平静。然而，自卫队为了防备未来可能的威胁，秘密制造了以哥斯拉细胞为基础的武器“抗核细菌”（ANB），并改造了曾与哥斯拉对抗的超级武器“Super_X”，升级为“Super X2”。突然，哥斯拉在三原山复活，引发连续地震，白神博士的女儿细胞与玫瑰细胞混合的植物因此死亡，使他决定加入ANB计划。白神博士利用哥斯拉细胞与女儿细胞混合的技术，成功制造出不死植物碧奥兰蒂。然而，一次意外事件中，碧奥兰蒂被释放并在芦之湖急速巨化。与此同时，三原山爆炸，哥斯拉再度现身并朝东京进发，自卫队无力阻止其前进。唯一能够阻挡哥斯拉的“Super X2”在激烈战斗中失利，使得哥斯拉转向了碧奥兰蒂所在地。